한국오르가니스트협회의 가장 크고 중요한 사업으로
매년 6월에 열리는 전국규모의 오르가니스트대회가 있다.
매년 외국의 저명한 2명의 오르가니스트들을 초청하여
주제에 맞는 특강과 연주회를 열고 접수를
받아 마스터클래스를 연다.
그리고 1년에 2회 서울과 지방에서
오르간 음악과 교회음악에 관한 특강을 개최하고 있으며
한국오르가니스트협회 주최로 콩쿨을 열어
전국오르가니스트대회때 콩쿨 입상자들의
연주회를 기획하고 있다.